La Reserva de la biosfera La Sepultura se localiza en una de las áreas de mayor riqueza biológica de Chiapas ya que esta es la zona de transición entre el Istmo de Tehuantepec, una región de poca humedad y mucho viento y la zona del Soconusco una de las regiones más húmedas de Chiapas. 

En La Sepultura encontramos una gran diversidad de ecosistemas desde la Selva caducifolia hasta el bosque de niebla y la sabana con pinos. En esta región se forman ríos que abastecen de agua a ciudades como Arriaga y Tonalá, del lado del Pacífico, siendo de gran importancia para las actividades pesqueras y a otras ciudades como Villaflores, Cintalapa y Tuxtla Gutiérrez del lado de la depresión central de Chiapas.