En su territorio de más de 144 mil hectáreas podemos encontrar los manglares más altos de Mesoamérica. Esta reserva enfrenta actualmente grandes retos para asegurar su permanencia y sustentabilidad; la fuerte presión que ejercen los humanos pone en riesgo los grandes servicios ecosistémicos que nos brinda. Una de sus principales amenazas son los incendios forestales, en su mayoría ocasionados por la cacería de fauna silvestre, específicamente de la tortuga de agua dulce, iguana verde, cocodrilos y venado cola blanca, que habitan en vegetación de tular y popal.